Cómo se usa
- Pega el tiempo y la lectura, uno por línea. Dos columnas sacadas directamente de una hoja de cálculo funcionan.
- Introduce la unidad de tiempo. El tiempo de duplicación vuelve en ella.
- Revisa la ventana que se ha elegido y el tiempo de duplicación. La ventana se dibuja más gruesa en el gráfico.
- Mira los demás candidatos de la tabla, ordenados por lo bien que fija cada uno la velocidad.
- Lleva el tiempo de duplicación a la calculadora de siembra celular para el siguiente pase.
Las fórmulas y lo que hay que vigilar
El crecimiento exponencial es una recta en cuanto tomas logaritmos. La aritmética es un solo ajuste por mínimos cuadrados; lo difícil es dónde cortar.
El ajuste
Mínimos cuadrados de ln(lectura) frente al tiempo. La pendiente es la velocidad de crecimiento.
- Modelo
- ln y = ln y₀ + µt
- Tiempo de duplicación
- ln2 / µ
Cómo se elige la ventana
Se ajusta cada tramo de tres o más lecturas consecutivas, y gana el que fija µ con más precisión.
- EE de µ
- s / √Σ(tᵢ − t̄)²
- s
- desviación estándar residual
Lo que hay que vigilar
- ⛔ Ordenar las ventanas por r² elige siempre la más corta. Tres puntos están en una recta sean los que sean, y el r² llama a eso el mejor ajuste.
- Una regla del tipo «la ventana más larga con un r² por encima de 0.99» solo traslada la arbitrariedad al umbral. El error estándar tiene a la longitud y a la rectitud tirando la una de la otra, sin ninguna constante que ajustar.
- El tiempo de duplicación no depende de la unidad de medida. Sea DO o recuento celular, un factor constante solo desplaza la ordenada en el origen.
- Las lecturas de cero o menos no se pueden logaritmar y se dejan fuera, con su recuento; ese recuento suele ser lo interesante.
- Los tramos que bajan no son candidatos. La fase de muerte forma parte de la curva, pero no es crecimiento exponencial.
- Elegir una ventana sigue siendo un juicio. Esto ordena a los candidatos y enseña sus cuentas; decidir otra cosa a partir de la tabla está bien.
Preguntas frecuentes
Se usan a menudo juntas
Recuento celular
Convierte los recuentos de la cámara de Neubauer en células/mL, células totales y viabilidad.
Siembra celular y razón de subcultivo
Suspensión y medio para cada recipiente, a partir de tu densidad y viabilidad actuales: varios tipos de recipiente en un mismo plan, con los pocillos periféricos y la preparación en volumen ya contemplados.
Creador de gráficos con barras de error
Dibuja un gráfico de barras de error a partir de datos agrupados, con los estadísticos de resumen.