Análisis de secuencias
Alineamiento múltiple de secuencias
Alinea varias secuencias para revelar las regiones conservadas y cómo se relacionan entre sí.
Secuencias (FASTA)
Esto es un ejemplo. Haz clic en el recuadro para empezar a escribir y se borrará.
Ejemplos:
6 secuencias de proteína
Parámetros
Todavía no hay ningún alineamiento.
Pega o suelta secuencias a la izquierda y pulsa Alinear.
Cómo se usa
- Pega las secuencias en FASTA a la izquierda, o suelta un archivo en el cuadro.
- Pulsa Alinear. El alineamiento, el consenso y el árbol salen juntos.
- Lee las columnas: las conservadas son el objetivo, y la línea de resumen dice cuántas secuencias y columnas tienes delante.
Conviene saber
- El alineamiento ocurre en tu navegador. Nada de lo que pegues se envía, y una vez cargada la página no hace ninguna petición de red.
- El resumen indica cuántas pasadas hizo y cuánto tardó, así que un alineamiento lento se ve en lugar de resultar misterioso.
- Si se detiene con un árbol repetido lo dice. Significa que más pasadas no cambiarían la respuesta, no que algo haya fallado.
Preguntas frecuentes
Las de un trabajo de laboratorio corriente: una familia de genes emparentados, no un genoma. La línea de resumen da el tiempo que tardó, que es la guía honesta: si ese número incomoda, la entrada es demasiado grande para un navegador.
Sí. La matriz de puntuación sigue a lo que pegues.
Se insertan para hacer coincidir las secuencias. Consérvalos si pasas el alineamiento a otra herramienta: sin ellos las filas dejan de corresponderse columna a columna.
Las demás herramientas de secuencias
- Limpieza de FASTA — Ordena un FASTA pegado sin romper el alineamiento.
- Complemento inverso de ADN — Invierte, complementa o calcula el complemento inverso de una secuencia de nucleótidos.
- Traducción de ADN a proteína — Traducción en seis marcos y marcos de lectura abiertos, con los códigos del NCBI.