사용 방법
- 핵산 종류를 고릅니다. 종류에 따라 단위 분자량 기본값이 바뀝니다.
- 길이를 입력합니다. dsDNA는 염기쌍(bp), 단일가닥은 염기 수(nt)입니다.
- 질량(ng)과 물질량(pmol) 중 아는 쪽 한 칸만 채우고 계산 버튼을 누릅니다. 나머지 한 칸이 채워집니다.
- 결과와 함께 총 분자량과 분자 수(copies)가 표시됩니다.
- 단위 분자량은 수정할 수 있습니다. 기본값이 화면에 표시되며, 다른 값을 쓰는 관례가 있으면 직접 넣으면 됩니다. 핵산 종류를 바꾸면 기본값으로 되돌아갑니다.
지수는 e를 사용해 입력할 수 있습니다. 예를 들어 1.5×10⁻⁵ 은 1.5e-5 로 입력하면 계산됩니다.
공식 설명 및 주의사항
질량과 물질량은 분자량으로 이어집니다. 물질량은 질량을 분자량으로 나눈 값이고, 여기에 단위 배수를 맞추면 다음이 됩니다.
- 물질량
- pmol = 질량(ng) × 1000 ÷ 분자량(g/mol)
1000이 붙는 이유는 단위 차이입니다. ng은 10⁻⁹ g, pmol은 10⁻¹² mol이므로 그 비가 10³입니다.
핵산의 분자량은 길이에 비례하므로 이렇게 근사합니다.
- 분자량
- 분자량 ≈ 길이 × 단위 분자량
| 핵산 종류 | 단위 분자량 (기본값) |
|---|---|
| dsDNA | 650 g/mol per bp |
| ssDNA · 올리고 | 330 g/mol per nt |
| RNA | 340 g/mol per nt |
분자 수는 아보가드로 수로 환산합니다. 1 mol이 6.022 × 10²³ 개이므로 1 pmol은 6.022 × 10¹¹ 개입니다.
- 분자 수
- 분자 수 = pmol × 6.022 × 10¹¹
실무 주의사항
- 단위 분자량 값에는 관례가 갈립니다. dsDNA를 650으로 보는 곳과 660으로 보는 곳이 있고, 결과가 약 1.5% 달라집니다. 이 계산기가 값을 고칠 수 있게 해둔 이유이며, 어느 값을 썼는지 함께 기록해 두세요.
- 올리고는 길이 근사보다 실제 염기 조성으로 계산한 분자량이 정확합니다. 짧을수록 차이가 커집니다. 합성 업체가 제공하는 분자량이 있으면 그 값을 직접 넣으세요.
- dsDNA와 ssDNA를 혼동하지 마세요. 같은 길이라도 단위 분자량이 두 배 가까이 차이납니다.
- 길이는 실제 산물의 길이입니다. 플라스미드라면 전체 길이, PCR 산물이라면 증폭 산물의 길이입니다.
- 분자 수 계산은 모든 분자가 온전한 전장(full-length)이라고 가정합니다. 단편화가 있으면 실제 분자 수는 더 많고 길이는 더 짧습니다.