사용 방법
- 핵산 종류를 선택합니다. 종류에 따라 단위 분자량 기본값이 변경됩니다.
- 길이를 입력합니다. dsDNA는 염기쌍(bp), 단일가닥은 염기 수(nt)입니다.
- 질량(ng)과 물질량(pmol) 중 아는 쪽 한 칸만 입력하고 계산 버튼을 누릅니다. 나머지 한 칸이 자동으로 채워집니다.
- 결과와 함께 총 분자량과 분자 수(copies)가 표시됩니다.
- 단위 분자량은 수정할 수 있습니다. 기본값이 화면에 표시되며, 다른 값을 사용하는 관례가 있으면 직접 입력하면 됩니다. 핵산 종류를 변경하면 기본값으로 복원됩니다.
💡 지수는 e를 사용해 입력할 수 있습니다. 예를 들어 1.5×10⁻⁵ 은 1.5e-5 로 입력하면 계산됩니다.
공식 설명 및 주의사항
질량과 물질량은 분자량으로 이어집니다. 물질량은 질량을 분자량으로 나눈 값이고, 여기에 단위 배수를 맞추면 다음이 됩니다.
- 물질량
- pmol = 질량(ng) × 1000 ÷ 분자량(g/mol)
1000이 붙는 이유는 단위 차이입니다. ng은 10⁻⁹ g, pmol은 10⁻¹² mol이므로 그 비가 10³입니다.
핵산의 분자량은 길이에 비례하므로 다음과 같이 근사합니다.
- 분자량
- 분자량 ≈ 길이 × 단위 분자량
| 핵산 종류 | 단위 분자량 (기본값) |
|---|---|
| dsDNA | 650 g/mol per bp |
| ssDNA · 올리고 | 330 g/mol per nt |
| RNA | 340 g/mol per nt |
분자 수는 아보가드로 수로 환산합니다. 1 mol이 6.022 × 10²³ 개이므로 1 pmol은 6.022 × 10¹¹ 개입니다.
- 분자 수
- 분자 수 = pmol × 6.022 × 10¹¹
실무 주의사항
- 단위 분자량은 관례가 갈립니다. dsDNA를 650으로 적용하는 곳과 660으로 적용하는 곳이 있으며, 결과가 약 1.5 % 달라집니다. 이 계산기가 값을 수정할 수 있게 한 이유이며, 어느 값을 사용했는지 함께 기록해 두세요.
- 올리고는 길이 기반 근사보다 실제 염기 조성으로 계산한 분자량이 정확합니다. 길이가 짧을수록 차이가 커집니다. 합성 업체가 제공하는 분자량이 있으면 그 값을 직접 입력하세요.
- dsDNA와 ssDNA를 혼동하지 마세요. 같은 길이라도 단위 분자량이 2배 가까이 차이 납니다.
- 길이는 실제 산물의 길이입니다. 플라스미드라면 전체 길이, PCR 산물이라면 증폭 산물의 길이입니다.
- 분자 수 계산은 모든 분자가 온전한 전장(full-length)이라고 가정합니다. 단편화가 있으면 실제 분자 수는 더 많고 길이는 더 짧습니다.
자주 묻는 질문
둘 다 통용됩니다. 소속 기관이나 참고 문헌의 관례를 따르시고, 어느 값을 사용했는지 함께 기록하세요. 이 계산기는 650을 기본값으로 두되 수정할 수 있게 했습니다. 두 값의 차이는 약 1.5 %입니다.
이 계산기는 길이 × 330으로 근사합니다. 실제 분자량은 염기 조성에 따라 달라지며, 올리고가 짧을수록 차이가 큽니다. 정확한 값이 필요하면 업체가 제공한 분자량을 단위 분자량 칸에 직접 입력하지 말고, 총 분자량이 그 값이 되도록 환산해 사용하세요.
PCR 산물·플라스미드·제한효소 절편은 이중가닥(dsDNA)입니다. 프라이머·프로브·합성 올리고는 단일가닥입니다. cDNA는 합성 방식에 따라 다르므로 프로토콜을 확인하세요.
qPCR 절대 정량의 표준물질을 조제할 때 사용합니다. 「반응당 10⁵ copies」처럼 분자 수 기준으로 표준곡선을 설정하는 경우가 많습니다.
가능합니다. 핵산 종류에서 RNA를 선택하면 단위 분자량이 340으로 변경됩니다. 다만 RNA는 이차 구조와 분해로 인해 실제 정량이 DNA보다 까다롭다는 점을 감안하세요.
여기서 얻은 pmol이나 분자 수를 희석배수 계산기나 연속 희석 준비 계산기의 초기 농도로 입력하면 됩니다.