사용 방법
- 이중가닥 DNA·단일가닥 DNA·RNA 중에서 선택합니다. 선택에 따라 길이 단위가 변경됩니다. 앞의 것은 염기쌍, 뒤의 둘은 뉴클레오티드입니다.
- 길이를 입력합니다.
- 단위당 평균 분자량은 자동 입력됩니다. 사용하는 프로토콜이 다른 값을 적용하면 변경하세요. bp당 660 g/mol도 650만큼 널리 사용됩니다.
- 필요하면 pmol 단위 양을 입력하세요. 해당 질량(µg)과 분자 개수가 함께 산출됩니다.
💡 지수는 e를 사용해 입력할 수 있습니다. 예를 들어 1.5×10⁻⁵ 은 1.5e-5 로 입력하면 계산됩니다.
공식 설명 및 주의사항
핵산의 분자량은 통상 정확한 계산이 아니라 추정값입니다. 길이에 염기쌍 하나 또는 뉴클레오티드 하나의 평균 질량을 곱합니다. 이 도구가 하는 일이 그것이며, 결과의 불확실성은 전부 「평균」이라는 단어에 들어 있습니다.
세 줄을 순서대로 적용합니다.
- 분자량
- MW (g/mol) = 길이 × 단위당 평균 무게
- 1 pmol의 질량
- m (µg) = MW × 10⁻¹² mol × 10⁶ = MW × 10⁻⁶
- 1 pmol에 든 분자 수
- N = 6.022 × 10¹¹
이 도구가 출발점으로 쓰는 평균값
| 종류 | 길이 단위 | 단위당 g/mol |
|---|---|---|
| 이중가닥 DNA | 염기쌍 (bp) | 650 |
| 단일가닥 DNA | 뉴클레오티드 (nt) | 330 |
| RNA | 뉴클레오티드 (nt) | 340 |
단일가닥 값이 이중가닥 값의 절반에 근접하는 것은 우연이 아닙니다. 염기쌍 하나가 뉴클레오티드 둘이기 때문입니다. 소폭 어긋나는 것은 평균값이라서이지 오류가 아닙니다.
실무 주의사항
- ⚠️ 이중가닥 DNA의 염기쌍당 질량으로 650과 660 g/mol이 모두 통용되며, 결과가 1.5 % 차이 납니다. 이 칸을 상수가 아니라 입력값으로 둔 이유가 바로 그것입니다. 참고하는 자료가 사용하는 값을 입력하세요.
- 여기서 사용하는 단위당 질량은 ng ↔ pmol 변환기와 동일하며, 코드에서도 같은 위치를 참조합니다. 같은 사이트의 두 도구가 동일한 분자에 다른 값을 내는 것은 어떤 검사로도 잡히지 않는 결함이라, 값을 복사하지 않고 공유합니다.
- 짧은 올리고에서 이 추정의 정확도가 가장 낮습니다. A만 20개인 20-mer는 C만 20개인 20-mer보다 뚜렷하게 무겁고, 염기가 20개뿐이면 네 염기를 평균한 값이 좋은 근사가 되지 못합니다. 공급사 사양서에 정확한 값이 기재되어 있습니다.
- 5′ 말단은 이 계산에서 고려하지 않습니다. 인산기 하나가 약 80 g/mol이며, 20-mer에서는 유의미하지만 플라스미드에서는 무시할 수 있습니다.
- kDa는 분자량을 1000으로 나눈 값이며, 공급사들이 그렇게 표기합니다. 1 kb 단편이면 약 650 kDa입니다. 다른 계산이어서가 아니라 그 표기가 통용되기 때문에 함께 표시합니다.
자주 묻는 질문
둘 다 통용되며 어느 쪽도 틀리지 않았습니다. 650이 더 단순화된 값이고, 660은 대이온까지 포함해 조성을 평균한 값에 가깝습니다. 차이는 1.5 %로, 일반적인 농도 측정 오차보다는 작고 정밀 측정의 오차보다는 큽니다. 프로토콜이 사용한 값을 적용하고, 어느 쪽인지 기록해 두세요.
공급사는 평균이 아니라 실제 서열로 계산하기 때문입니다. 20-mer에서는 수 퍼센트까지 차이가 나고, 5 kb 단편에서는 무시할 수준이 됩니다. 공급사 값이 있으면 그것을 사용하세요. 이 도구는 길이 정보만 있을 때를 위한 것입니다.
bp당 650 g/mol 기준으로 약 0.65 µg입니다. 1000 bp × 650 = 650 000 g/mol이고, 1 pmol은 분자량을 피코그램으로 읽고 10⁶을 곱한 질량이므로 0.65 µg이 됩니다.
g/mol을 1000으로 나눈 동일한 수치이므로 다른 단위와 마찬가지로 성립합니다. 공급사와 크기 마커가 그 표기를 사용하기 때문에 함께 제공합니다. 핵산에서는 bp 길이가 더 많은 정보를 주므로, 이 도구에서는 그쪽이 출력이 아니라 입력입니다.
둘 다 염기 조성에 대한 평균값이며, 서로 다른 출처가 수십 년의 간격을 두고 각자 반올림했기 때문입니다. 2 × 330은 660이고, 그것이 통용되는 또 다른 이중가닥 값입니다. 두 관행 사이의 10 g/mol 차이가 「650이냐 660이냐」 논쟁의 전부입니다.
포함되지 않습니다. 단위당 평균값은 잔기 기준이라 5′ 인산기 약 80 g/mol은 계산에 넣지 않습니다. 20-mer에서 0.25 % 정도이고 플라스미드에서는 무시할 수준이지만, 질량분석 결과와 대조할 때는 알아 둘 값입니다.
참고문헌
기본값 650 · 330 · 340 g/mol의 출처입니다. 길이 × 단위 분자량 자체는 정의이며, 값은 입력칸에서 변경할 수 있습니다.
- New England Biolabs. Nucleic Acid Data (usage guidelines). Read 2026-08-21.https://www.neb.com/en/tools-and-resources/usage-guidelines/nucleic-acid-datadsDNA 650 g/mol per bp — 「MW = 염기쌍 수 × 650 daltons」. 같은 쪽의 「1 pmol of 1000 bp DNA = 0.66 µg」 가 이 도구가 말하는 「660 도 쓰인다」의 660 입니다
- Promega Corporation. Nucleotides and Nucleic Acids (Technical Reference, Part #GE634). 2010.https://www.promega.com/-/media/files/resources/technical-references/nucleotides-and-nucleic-acids.pdfssDNA 330 · RNA 340 g/mol per nt — 「Standards」 항목. 같은 표가 dsDNA 는 660 으로 적어, 650 과 660 이 둘 다 쓰이는 값임을 보여 줍니다