사용 방법
- 젤 한 장의 부피(mL)와 목표 농도(%)를 입력합니다. 여기서 %는 질량/부피 백분율이므로, 1 %는 버퍼 100 mL에 아가로스 1 g이라는 뜻입니다.
- 젤을 여러 장 제작할 때는 장수를 올립니다. 부피와 질량이 함께 증가합니다.
- 보유한 러닝버퍼 원액을 선택합니다. 50× TAE, 10× TBE, 5× TBE가 준비되어 있으며, 다른 원액을 사용한다면 배수를 직접 입력하면 됩니다.
- 염색약 원액의 농축배수를 입력하면 투입 부피가 함께 산출됩니다. 염색약 부피는 증류수에서 차감하므로 총 부피는 처음 입력한 값과 동일합니다.
- 분리하려는 DNA 크기(bp)를 입력하면 아래 표에서 해당 크기를 다룰 수 있는 농도에 표시가 붙습니다.
공식 설명 및 주의사항
아가로스 젤은 그물망의 공극 크기로 DNA를 분리합니다. 아가로스 농도가 높을수록 공극이 조밀해져 작은 단편이 잘 분리되고, 농도가 낮을수록 큰 단편이 분리됩니다. 따라서 「몇 %를 쓸까」는 계산이 아니라 표를 확인하는 일입니다.
계산식
네 줄이 전부입니다. 총 부피는 젤 한 장의 부피에 장수를 곱한 값입니다.
- 아가로스 질량 (g)
- 목표 농도(%) ÷ 100 × 총 부피(mL)
- 러닝버퍼 원액 (mL)
- 총 부피 ÷ 원액 배수
- 염색약 (μL)
- 총 부피 ÷ 농축배수 × 1000
- 증류수 (mL)
- 총 부피 − 러닝버퍼 원액 − 염색약
실무 주의사항
- 에티듐 브로마이드(EtBr)는 변이원으로 의심되는 물질입니다. 장갑을 착용하고 취급하며, 젤과 러닝버퍼·빗·트레이까지 오염 처리 대상으로 간주하세요. 젤에 미리 첨가하는 방법은 간편한 대신 장비를 오염시키고 선형 DNA의 이동을 15 % 정도 지연시킵니다. 전기영동 종료 후 침지 염색하면 장비 오염과 사용량을 줄일 수 있습니다.
- EtBr 사용 시 통상적인 농도는 최종 0.5 μg/mL입니다. 이 계산기는 특정 염색약을 기본값으로 두지 않습니다. 보유하신 제품의 농축배수를 입력해 주세요.
- TAE는 완충 능력이 TBE보다 낮아 장시간 전기영동하면 먼저 소진됩니다. TBE는 밴드가 더 선명하고 특히 1 kb 미만에서 유리하지만, 붕산이 당과 착물을 형성해 젤에서 DNA를 회수하기 어렵게 만듭니다. 절단 후 정제할 젤이라면 TAE가 무난합니다.
- 아가로스는 순도가 높은 제품을 사용하세요. 다당류·염·단백질 같은 불순물이 이동을 교란하며, 고농도 젤일수록 그 영향이 큽니다.
- 이 계산은 부피와 질량의 산술일 뿐이며, 실제 분리능은 전압·전기영동 시간·장비에 따라 달라집니다. 표의 범위는 출발점으로 활용하세요.
자주 묻는 질문
분리하려는 단편 크기로 결정합니다. 계산기에 크기(bp)를 입력하면 표에서 사용 가능한 농도에 표시가 붙습니다. 대략 큰 단편(10 kb 이상)은 0.5–0.7 %, 일반적인 PCR 산물(0.5–10 kb)은 1 %, 작은 단편(1 kb 미만)은 1.5–2 %입니다.
질량/부피(w/v) 기준입니다. 1 % 젤은 버퍼 100 mL에 아가로스 1 g입니다. 이 계산기도 동일하게 계산합니다.
가능합니다. 원액 종류를 변경하면 투입할 원액 부피만 달라지고 아가로스 질량은 동일합니다. TBE 원액을 5×로 조제하는 곳도 있어 세 가지를 모두 준비했습니다. 다른 배수를 사용하면 직접 입력하세요.
아가로스를 완전히 용해한 뒤 손으로 잡을 수 있을 정도로 냉각해 붓기 직전에 첨가합니다. 끓는 상태에서 첨가하면 염색약이 변성되고 증기로 손실됩니다.
가장 가까운 행으로 답하고, 표에 없는 값이라는 사실을 함께 안내합니다. 0.3–2.0 % 범위 밖이면 분리 범위를 제시하지 않습니다. 근거 없이 추정하지 않기 위해서입니다.
참고문헌
젤 농도–분리 범위 표의 출처입니다. 질량·버퍼·염색약 계산은 곱셈 한 번과 나눗셈 두 번이라 인용하지 않습니다.
- QIAGEN. Bench Guide — DNA analysis using analytical gels, table "Concentration of agarose used for separating fragments of different sizes". Read 2026-08-21.https://www.qiagen.com/us/knowledge-and-support/knowledge-hub/bench-guide/dna/analysing-dna/dna-analysis-using-analytical-gels0.3 %–2.0 % 일곱 행 전체(별표 둘 포함)와 「0.1–25 kb」 전체 범위. 2026-08-21에 렌더된 페이지에서 재확인해 행마다 일치했습니다