Diseñador de placas de PCR y calculadora de master mix
Guardar deja la placa en este navegador. Van 0 guardadas; volver a guardar con el mismo experimento, fecha e ID sustituye esa entrada en vez de añadir otra. Para quitar una placa guardada, elimínala desde la lista de Cargar.
Alícuota de master mix
Selecciona pocillos haciendo clic o arrastrando y elige después un master mix.
Selecciona antes algunos pocillos.
Alícuota de molde
Selecciona pocillos haciendo clic o arrastrando y elige después un molde. Solo están abiertos los pocillos que ya tienen un master mix.
Selecciona antes algunos pocillos.
Master mix
El “agua (relleno)” es el agua que lleva una reacción hasta su volumen. El agua que se usa como control negativo es un molde y vive en la otra tabla. Son cosas distintas.
0 reacciones
| Componente | Va | Conc. madre | Conc. final | µL / pocillo | µL totales | Acciones |
|---|---|---|---|---|---|---|
| — | ||||||
| — | — |
- Por pocillo
- —
- Preparar en total
- —
- Reacciones preparadas
- 0
- Ningún pocillo lleva este master mix, así que no hay nada que preparar. Asigna algunos pocillos en la placa de arriba.
- Un componente todavía no tiene valor, así que no se ha calculado nada.
Moldes y muestras
0 de 96 pocillos en uso
Se guarda en este navegador sobre la marcha, así que sigue aquí cuando vuelvas. Exporta un archivo para llevarlo a otro equipo o para conservar más de una placa: la herramienta guarda una cada vez.
El libro tiene tres hojas —distribución de la placa, master mix y moldes— y conserva los colores y las reglas. Es para leerlo; para volver a cargar una placa en esta herramienta, usa el archivo de placa (.json).
Cómo se usa
- Rellena el experimento, la fecha y el ID. Una hoja impresa tiene que poder decir a qué serie pertenece.
- Selecciona pocillos en la alícuota de master mix. Arrastra sobre ellos, o usa la cabecera de una fila para los 12 pocillos de esa fila y la de una columna para los 8 de esa columna. Mayús amplía la selección y Ctrl añade un pocillo suelto.
- Asigna un master mix a la selección. Su color se queda en esos pocillos.
- Pasa a la alícuota de molde y pon las muestras, los estándares, el CP y el CN en esos mismos pocillos. Los pocillos sin mezcla están bloqueados; al hacer clic en uno se te pregunta qué mezcla debe llevar.
- Escribe la receta de la mezcla en la tabla de abajo. No hay ningún campo para el número de reacciones: se cuenta en la placa.
- Abre la vista previa de impresión, elige horizontal o vertical e imprime una página. El papel no tiene ventanas emergentes de ayuda, así que las tablas son la leyenda.
Fórmulas y advertencias
- Volumen por reacción = el valor que has introducido, o (final ÷ madre) × volumen de reacción cuando se da un par de concentraciones
- Agua (relleno) = volumen de reacción − todo lo demás sumado
- Por reacción = los componentes que van en la mezcla, más el relleno. Los componentes que se añaden aparte no forman parte de esto.
- Preparar en total = por reacción × reacciones × (1 + % de exceso), o por reacción × (reacciones + reacciones adicionales)
- Un par de concentraciones manda sobre un volumen escrito a mano, porque es el que sigue al volumen de reacción cuando este cambia.
- Si los componentes ya superan el volumen de reacción, el relleno se comunica como un problema en vez de mostrarse como un número negativo.
Lo que esta herramienta no hace
- Placas de 384 pocillos: por ahora solo de 96.
- Placas que no son de PCR, como las de ELISA: otras distribuciones y otras reglas.
- Distribuciones automáticas o aleatorizadas: dónde va cada cosa lo decides tú.
- Análisis de resultados como los valores de Ct: esta es una herramienta para antes de la serie.
- Exportación para un equipo concreto: lo que escribe es un .json que puede volver a leer.
- ⚠️ Los volúmenes son una guía. El error de pipeteo y el volumen muerto te toca cubrirlos a ti con el campo de exceso.
Preguntas
Se usan a menudo juntas
Tm de cebadores
Temperatura de fusión de cebadores y oligonucleótidos por el modelo del vecino más próximo.
Cuantificación relativa por qPCR
Calcula los cambios de expresión respecto a un grupo control a partir de valores de Ct de qPCR.
Eficiencia de amplificación en qPCR
Calcula la eficiencia de amplificación (%) y el factor por ciclo a partir de la pendiente de una curva estándar.